O Porto Brasil Sul sera construído em uma área de 146 hectares, na saída do canal de acesso ao Porto de São Francisco do Sul. Terá 1,2 milhão de metros quadrados de área destinada aos terminais, setores comuns e centro administrativo.
Será um dos primeiros portos verdes da América Latina, já nascendo com o compromisso de redução de impactos e preservação ambiental.
A área onde será instalado o Porto Brasil Sul já havia sido mapeada nos anos de 1990, sob a coordenação do Governo Federal. Já na época a área da Ponta do Sumidouro era apontada como a ideal para um porto de águas profundas, moderno e competitivo, para atender o Sul e Sudeste do Brasil e países do Mercosul.